金橘的常见病害为根腐病，大多是由于土壤清水引起的。
防治方法：
盆栽者烂根的比较多，宜注意排除地下水，盆栽时宜苗盆相称，盆土不能过湿，以增强树势，减少发病率。初发生时，可适当节水、排水；严重时很难恢复，可及早除去病株，加强键株的管理。经常喷洒波尔多液、800信代森铵、2000倍甲基拖布津等药剂预防。
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