马蔺具有极强的抗病虫害能力，一般没有病虫害。在衡水地区马蔺常被小地老虎危害，小地老虎一年发生3代，小龄幼虫将叶子啃食成孔洞、缺刻，大龄幼虫白天潜伏于根部土中，傍晚和夜间切断近地面的根茎部，使植株叶片干枯，影响观赏效果。
药剂防治：幼虫3龄前防治效果最好。用5%的辛硫磷颗粒加细土30倍，拌匀后均匀撒在草坪上；或喷洒50%辛硫磷液1000倍液。
生物防治：黑光灯或糖醋液诱杀成虫，设置时间从3月初至5月底。灯下放置盛水的大缸，水面撒上机油。糖醋液的配置方法是：红糖1份，醋3份，水10份，加入少量敌百虫药液搅拌均匀。于无风晴天的傍晚放在苗间，天明后收回，将蛾子收集并深埋处理。
植株被啃食后，上部叶片死亡，防治后还可从基部钻出新的叶片，重新恢复往日生机。马蔺单一植被群落中几乎不发生病虫害，且由于它有特殊的分泌物，其与其他植物混植后也极少发生病虫害，大大降低了绿色地被建植后防治病虫害所需的投入和成本。
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